Zwischen Haag und St. Valentin war in Fahrrichtung Linz die rechte Spur überschwemmt und nicht benützbar.
Gesperrt waren weiters die Donau-Bundesstraße (B 3) im Abschnitt Krems-Stein – Weissenkirchen, die Gföhler Bundesstraße (B 32) von Gföhl bis Wegscheid. Die Kamp-Brücke bei Thurnberg wurde von den Fluten weggerissen. Ebenfalls unpassierbar war die B 33 im Bereich Melk bis zur Donaubrücke Mautern. Überschwemmt war auch die Umleitung über die L 109. Eine Ausweichmöglichkeit bestand laut ÖAMTC somit nur über die A 1 und die S 33.
Die weiteren von Hochwasser-Sperren betroffenen Verbindungen im höherrangigen Straßennetz in Niederösterreich: Kamptal-Bundesstraße (B 34) von Hadersdorf am Kamp bis zur Anschlussstelle Horn-Süd, Retzer Bundesstraße (B 35) von Krems-Nord bis Mitterretzbach, Zwettler Bundesstraße (B 36) in Zwettl, Kremser Bundesstraße (B 37) im Abschnitt Rastenfeld – Gföhl, Böhmerwalde-Bundesstraße (B 38) in Altenburg und Zwettl, Gmünder Bundesstraße (B 41) von St. Martin bis Weitra, Greiner Bundesstraße (B 119) von Groß-Gerungs bis Weitra und Ottenschlager Bundesstraße (B 217) im Abschnitt Mühldorf – Spitz a.d. Donau.
Ebenfalls gesperrt waren laut ÖAMTC folgende Landesstraßen: L 59 im Bereich Karlstein, L 68 bei Haid, L 2049 bei Schwechat, L 97 (Blindenmarkt – Steinakirchen), L 6058 (Ardagger Markt – Wallsee), L 8164 (Edlitz – Oberedlitz), L 8163 (Vestenpoppen – Wohlfahrts), L 8044 (Steinegg – St. Leonhard am Forst), L 8225 (Grenzübergang Gmünd) und L 73 (Marbach am Felde – Lichtenau).
Wegen Überflutungen erschwert passierbar waren laut ÖAMTC die L 7054, L 7050 und L 7051 im Bereich Rastenfeld-Steinegg. Gesperrt waren darüber hinaus zahlreiche Straßen im vom Hochwasser besonders schwer betroffenen Bezirk Horn. Überflutet war auch die P & R-Anlage beim Bahnhof Klosterneuburg-Kierling.